Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX5BP10606 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms