Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms