Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PGA3P0DJD8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGA3P0DJD8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms