Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD2P0DJD1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms