Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms