Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACAA1P09110 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms