Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEFMP07197 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEFMP07197 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFMP07197 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFMP07197 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFMP07197 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFMP07197 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEFMP07197 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEFMP07197 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms