Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYBBP04839 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYBBP04839 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYBBP04839 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYBBP04839 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms