Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYF2O95926 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYF2O95926 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYF2O95926 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms