Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX58O95786 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX58O95786 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX58O95786 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX58O95786 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX58O95786 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms