Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNKO75909 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms