Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRMUO75648 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRMUO75648 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRMUO75648 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRMUO75648 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRMUO75648 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRMUO75648 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRMUO75648 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms