Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP6O75581 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP6O75581 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP6O75581 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRP6O75581 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRP6O75581 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP6O75581 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP6O75581 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP6O75581 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms