Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE8AO60658 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE8AO60658 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms