Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GMDSO60547 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GMDSO60547 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GMDSO60547 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GMDSO60547 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms