Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DENRO43583 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DENRO43583 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DENRO43583 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DENRO43583 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms