Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OIP5O43482 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OIP5O43482 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OIP5O43482 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OIP5O43482 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OIP5O43482 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OIP5O43482 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OIP5O43482 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OIP5O43482 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OIP5O43482 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms