Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP2O14595 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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