Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRTO14522 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
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