Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE40O14503 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms