Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CROCC2H7BZ55 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CROCC2H7BZ55 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms