Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DGG1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DGG1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DGG1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
B4DGG1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms