Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A8MVJ9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A8MVJ9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
A8MVJ9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
A8MVJ9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
A8MVJ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms