Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL33A6NCF5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL33A6NCF5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms