Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C5orf49A4QMS7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms