Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM221AA4D161 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms