Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1C4

TRBV27, T-cell receptor beta variable 27 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV27A0A0K0K1C4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRBV27A0A0K0K1C4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV27A0A0K0K1C4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV27A0A0K0K1C4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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