Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PARP3Q9Y6F1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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