Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COG6Q9Y2V7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms