Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHF24Q9UPV7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF24Q9UPV7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms