Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM35Q9UPQ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms