Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX12Q9UMY4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms