Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42EP3Q9UKI2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDC42EP3Q9UKI2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms