Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP25Q9UHP3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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