Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R1BQ9UD71 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R1BQ9UD71 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms