Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COPS7AQ9UBW8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPS7AQ9UBW8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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