Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
XCL2Q9UBD3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms