Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC88CQ9P219 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms