Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHRF1Q9P1Y6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms