Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms