Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ASF1BQ9NVP2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms