Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCIQ9NVI1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCIQ9NVI1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms