Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXD4L1Q9NU39 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms