Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms