Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ABCC13Q9NSE7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ABCC13Q9NSE7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms