Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TM7SF3Q9NS93 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms