Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRHQ9HD43 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms