Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRMS1Q9HCU9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRMS1Q9HCU9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms