Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SENP6Q9GZR1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SENP6Q9GZR1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SENP6Q9GZR1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SENP6Q9GZR1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms