Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms